Entren en contacto donde entren los EM con masa orgánica, adquieren nuevas conexiones. Esto puede suceder totalmente en la cañería de agua. El agua puede llevar cloro o estar contaminada por la saliva de los animales que beben de ella. Como reacción existe el peligro de que en una cañería de este tipo caigan mucosidades. Con este riesgo no recomendamos que se apliquen EM sobre la cañería.